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組學金標準Orbitrap技術平臺助力揭示不老分子的抗衰奧秘

閱讀:68      發布時間:2022-12-16
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近年來, NAD+的前體NMN作為抗衰老保健品成為京東Z ui暢銷的商品之一,這是因為NAD+可能和每個人的健康壽命都有關系。這激勵著更多科學家們開展研究,探索NAD+多靶標抗衰老的功效和機理。基于Orbitrap質譜的蛋白質組學研究方法在NAD+的研究中發揮重要的作用。賽默飛深度合作伙伴清華大學蛋白質化學與組學平臺主管鄧海騰教授,研究NAD+ 20余年,并正在用蛋白質組學和質譜技術,揭示生命更多的奧秘。

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賦能創新

組學金標準

完整workflow

清華大學蛋白質化學與組學平臺隸屬于清華大學蛋白質研究技術中心,致力于發展和應用蛋白組學、代謝組學以及化學生物學的技術方法,向全校各實驗室和研究中心提供質譜、蛋白質組學和代謝組學的分析服務,包括常規的蛋白質鑒定、蛋白N/C端分析、蛋白質質量精準測定、蛋白-配體相互作用分析、定量蛋白質組學分析、抗體全序列測定、組蛋白翻譯后修飾譜分析,以及高階發展功能蛋白質組學等。

鄧海騰教授任洛克菲勒大學研究副教授和蛋白質組學分析中心主任時,與賽默飛建立了緊密合作關系,2011年回國主持平臺日常工作,使用的質譜技術,主要為Orbitrap技術平臺。從早期LCQ和LTQ開始,到現在的二合一質譜,以及“性能比肩 通用萬間"的三合一質譜,用其不斷地挑戰蛋白組學領域難題。

△Thermo Scientific™ Orbitrap Ascend

三合一質譜系統

在基礎科研方面,鄧教授關注于氧化還原生物學,研究其在生物過程中的功能和作用機制;在轉化醫學的應用層面,致力于發展衰老及其相關疾病的生物標志物,開發提高健康壽命的小分子植物提取物、納米抗體和疫苗類新型分子。通過多年的探索,鄧教授課題組已發展出一套從基礎到轉化的工作流程,從功能蛋白質組學出發發現靶標,篩選針對靶標的抗體和抑制劑,進而對抗體進行表達、純化和功能化修飾,并研究這些分子在細胞和動物疾病模型中的功能和作用機制,取得了zhuo越的科研成果。

智領前沿

20年NAD+研究

探索抗衰機理


NAD+(Nicotinamide adenine dinucleotide),全稱煙酰an腺嘌呤二核苷酸,是維持人體生理功能的關鍵分子,從亞瑟·哈登1904年發現輔酶NAD+并獲得Nobel獎以來,NAD+一直是生物醫學研究的熱點。它作為輔酶參與各類氧化還原反應,同時也參與了細胞能量代謝、信號傳導和基因轉錄調控等過程。實驗動物和臨床研究表明,隨著年齡的增長NAD+的水平大幅下降,而提高機體NAD+水平,能夠改善甚至逆轉多種衰老相關疾病的發生發展,提高健康壽命。近年來被追捧的煙酰an單核苷酸(NMN)是NAD+的一種前體和高效補充劑。

圖片2.png

△NAD+的分子式


NAD+研究的難點是其既可以作為輔酶,同時也是DNA修復酶PARP、去乙酰化酶Sirtuins的底物。藥物分子大都作用于一個靶標,而NMN補充則會影響細胞中多個生物過程。鄧教授基于組學金標準Orbitrap技術平臺,通過定量蛋白質組學,發現小鼠腎臟內過氧化物酶體的數量隨著衰老而顯著減少;小鼠服用NMN 1-2個月后,腎臟組織中的過氧化物酶體的數量大幅提高,增強腎臟的代謝水平,改善腎臟對損傷的反應。通過實驗進一步發現,在衰老的小鼠肝臟中,大部分高表達的酶都是抗氧化酶和解毒酶,調控這些酶表達的轉錄因子Nrf-2也高度分布在細胞核中,而衰老小鼠服用NMN以后,細胞核中的Nrf-2降低,提高了細胞的抗應激能力,保護了肝臟的生理功能,這可能是NMN最重要的生理功能。

近20年我們一直開展NAD+的研究,比較大的貢獻是發現了一些作用機理。早期shou次鑒定CD38和Sir2的反應中間體,目前關注于NAD+的各種前體,包括NMN的研究,揭示了NMN通過抑制炎癥因子分泌,提高機體抵抗炎癥的能力。

鄧教授課題組相繼在《細胞化學生物學》、《衰老》、《自由基生物學與醫學》、《蛋白質組學研究》、《分子生物學前沿》和《細胞凋亡和疾病》等雜志上發表了一系列關于NAD+的研究論文,揭示了NMN及其衍生物的重要生物學功能和作用機制,并shou次合成了還原型的NMN(NMNH),它在細胞水平和動物水平都具有更強地提高NAD+含量的功能,是一種高效的NAD+促進劑。通過多組學的大數據分析闡明了NMN新的生物學功能及作用機制,為衰老科學的發展提供了線索與研究思路。

攜手同行

當組學研究者遇見

金標準Orbitrap技術

若沒有質譜,當今大部分生物醫學的研究,尤其是蛋白質相關的研究會受到很多限制。賽默飛質譜一直是我們實驗室的主力儀器,我們近10年發表或參與發表的論文約230篇,每一篇都離不開賽默飛的質譜。沒有賽默飛的質譜,我們課題組的項目沒有一個能夠順利進行下去。

△鄧教授課題組的賽默飛質譜們

組學平臺對儀器的要求是穩定、易用,能為研究機構中許多不同的科研項目提供支持。從早期使用Orbitrap技術開始,對賽默飛質譜的印象就是:非常穩定、非常容易使用、數據非常準確,并能夠提供大量的信息。多年來,賽默飛質譜不斷創新,解決了眾多生物研究過程中的問題。選擇Orbitrap,是因為眾多的研究項目需要它。我經常帶學生回顧Orbitrap發展的歷史,這是儀器發展史shang閃光的一頁:從理論的一篇文章發展成商用質譜儀,2-3年發展出原型機,隨后迅速迭代出多種不同的、具有革命性創新的質譜儀。高達100萬的分辨率,為研究者提供了非常精確的蛋白質測量工具。近期推出的Orbitrap Ascend Tribrid,能夠令研究者更深入地認識蛋白質變體、認識翻譯后修飾,對蛋白質完整結構的認識達到更深入的層面。賽默飛的維修工程師很敬業,具有獻身精神,深夜維修儀器的身影令我難忘。

共創未來

攜手探索無限可能

作為平臺,鄧教授非常關注蛋白研究領域的變化和發展,比如當前熱門的mRNA疫苗,考慮將來能否直接用mRNA轉化為蛋白來改善人的健康狀況。鄧教授正在研究抗衰老疫苗,期望在3~5年后能推出一款商業化的產品,使得我們能夠健康工作更長的時間。未來,希望與賽默飛一同合作,發展更多的技術和方法。賽默飛在質譜領域始終秉承不斷創新的宗旨,持續與鄧教授及國內外組學專家學者深入合作,攜手共進,為組學的發展貢獻更大的力量!

圖片4.png

人物簡介 |PROFILE

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鄧海騰


平臺主管 教授 博士生導師

1996年在賓州州立大學獲得博士學位,之后在加拿大阿拉伯塔大學和美國橡樹嶺國家實驗室從事博士后研究,先后在愛因斯坦醫學院和內布拉斯加大學擔任助理教授,回國前任洛克菲勒大學研究副教授和蛋白質組學分析中心的主任。現擔任清華大學生命科學學院教授和蛋白質化學及組學平臺主管。主要研究領域為發展和應用蛋白質組學、代謝組學和化學生物學的技術和方法;研究氧化還原生物學在衰老和疾病中的功能和作用機制。

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