疾控中心實驗室在實驗過程中會產生一些有害氣體。顯然，這些廢氣排放到大氣中會破壞整體生態環境，因此這些廢氣必須經過專業的凈化處理才能排放。廢氣處理需要在進行整體實驗室設計時就應當加入，風管需要提前預設，廢氣需要通過風管排放。

噴淋塔是處理的重要組成部分，一般廢氣凈化噴淋塔位于屋頂，循環壓力泵和風扇聯動更方便廢氣快速處理，實驗室廢氣排放與其他有害物質排放相同，需要在疾控中心實驗室建設早期獲相關部門批準，建設批準后，避免后期出現實驗室查封等嚴重后果。

許多理化實驗室內都會設有通風柜和吸氣罩，疾控中心實驗室也不例外，像光譜以及色譜分析類的設備都會產生有害氣體，那么建議全部配備吸氣罩，在設計時根據整體實驗室環境確定好排氣罩的高度以及位置，留好可以調整的空間。

在做化學實驗的環境下,如需備有化學試劑倉庫，請將吸氣罩連接到試劑柜內，并配置實驗感應裝置，實現自動排氣。并詛每個通風柜都應當設置單獨的排風系統，也就是我們常說的"一柜一管的風機系統”，不要使用公共通用風道， 避免排風污染，也不能借用消防風道。

不要采用空氣會產生交換的空調系統，否則將會產生交叉污染。單獨的實驗室可以使用單獨的空調系統，單元組合實驗室則可以考慮設置風機盤管系統或者變頻變冷媒流里一拖多系統等。

疾控中心實驗室和一般的實驗室又有所不同，因為特殊用途，所以對廢氣、排風系統有了一些新的規定，在建設時應格外注意不能一概而論。