siRNA pools（即siPOOLs）是一款經(jīng)過優(yōu)化設(shè)計(jì)的高復(fù)雜性的包含30條siRNA的混合物，經(jīng)證明可有效消除脫靶效應(yīng)，提高了結(jié)果的可靠性（Hannus et al., 2014）。
E3 Ligase siPOOL library（RNAi試劑）
E3 Ligase siPOOL library（RNAi試劑）
siRNA pools（即siPOOLs）是一款經(jīng)過優(yōu)化設(shè)計(jì)的高復(fù)雜性的包含30條siRNA的混合物，經(jīng)證明可有效消除脫靶效應(yīng)，提高了結(jié)果的可靠性（Hannus et al., 2014）。Pack Hunter (pooling) 方法通過將當(dāng)個siRNA的濃度稀釋到刺激表型的閾值以下來對抗單個siRNA的脫靶。借助專有的設(shè)計(jì)算法，siPOOLs中的siRNA序列經(jīng)過優(yōu)化，以實(shí)現(xiàn)較大的轉(zhuǎn)錄本覆蓋率，高效雜交，且將旁系同源基因進(jìn)行了過濾，從而實(shí)現(xiàn)高效和特異性的基因沉默。
siPOOLs產(chǎn)品優(yōu)勢
使用簡單快捷 siPOOLs與多種轉(zhuǎn)染試劑兼容，幾天內(nèi)就能看到結(jié)果。
高度特異性且有效 siPOOLs在標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系中將脫靶率降低5-25倍，且在1-3 nM下實(shí)現(xiàn)基因敲低率≥70%。
一致的表型 與siRNA相比，由siPOOL產(chǎn)生的表型高度一致。
確保經(jīng)過檢驗(yàn) 采用RT-qPCR對siPOOL干擾效果進(jìn)行驗(yàn)證，如果在最佳轉(zhuǎn)染條件下，敲低率低于70%，則有可能重新設(shè)計(jì)。
使用專業(yè)的數(shù)據(jù)庫注釋進(jìn)行定制設(shè)計(jì) 專業(yè)的設(shè)計(jì)，確保優(yōu)化熱力學(xué)特性，且避免旁系同源基因的干擾。
HPLC純化且無毒 所有siPOOL均經(jīng)過HPLC純化，可降低污染物和副作用的風(fēng)險(xiǎn)。
為了確保siPOOLs針對當(dāng)前注釋的基因，設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)會根據(jù)新版的RefSeq注釋不斷更新siPOOL的設(shè)計(jì)。
siPOOL庫（siRNAs庫）：庫中的每個基因，都被30個池化的siRNA靶向。
產(chǎn)品名稱 | 物種 | 規(guī)格 | 貨號 |
E3連接酶siPOOL庫 | human | 1 nmol | si-L010-000E3L |
激酶siPOOL庫 | human | 1 nmol | si-L010-000505 |
RNA結(jié)合蛋白siPOOL庫 | human | 1 nmol | si-L010-000RBP |
GPCR siPOOL庫 | human | 1 nmol | si-L010-00GPCR |
泛素化酶 siPOOL庫 | mouse | 1 nmol | si-L010-000UBI |
更多規(guī)格，例如：0.1nmol、0.25nmol、0.5nmol等。
通常，siPOOLs采用帶條形編碼的離心管。不過，也可根據(jù)客戶需求定制96孔板或384孔板布局的siPOOLs產(chǎn)品。
運(yùn)輸和保存
siPOOL庫，以懸液的形式保存，常溫（RT）下運(yùn)輸。如果有特別要求，siPOOL也可以干粉形式運(yùn)輸。siPOOL庫可以穩(wěn)定地在RT下運(yùn)輸至少4周。
到達(dá)后，siPOOL庫應(yīng)存儲在-20°C至-80°C。在這樣的條件下，siPOOL庫至少穩(wěn)定兩年。
如果siPOOL庫以干粉形式運(yùn)輸，siPOOL應(yīng)在無RNase的水中重懸。
在客戶收到貨物（或重懸）后，我們建議您將siPOOLs分裝成小體積，存儲在-20°C到-80°C條件。為了達(dá)到最佳效果，盡量減少反復(fù)凍融的次數(shù)。在良好的儲存條件以及規(guī)范的操作處理下，siPOOLs可穩(wěn)定保存至少2年。對于靶向基因沉默，RNA干擾（RNAi)具有易于操作、快速結(jié)果、高效率、廣泛適用于各種細(xì)胞類型的多重優(yōu) 勢。其具有瞬轉(zhuǎn)效應(yīng)和劑量依賴效應(yīng)，這點(diǎn)與小分子非常相似。然而，目前的siRNA試劑其特異性和基因沉默效率可變，阻礙了它們作為藥物發(fā)現(xiàn)和基因研究工具的應(yīng)用。
siTOOLs Biotech由Michael Hannus博士和Gunter Meister教授于2013年9月成立，由德國雷根斯堡大學(xué) 和Intana Bioscience制藥服務(wù)公司聯(lián)合運(yùn)營。目前推出有3個產(chǎn)品系列：（1）siPOOLs：一種siRNA混合物，有 效增加基因沉默特異性，“稀釋”傳統(tǒng)RNA干擾試劑的脫靶效應(yīng)。（2）raPOOLs：一種穩(wěn)健的RNA親和純化方 案，適用于基因功能和相互作用的生物化學(xué)研究。（3）riboPOOLs：適合任意物種的核糖體RNA去除試劑，高效且經(jīng)濟(jì)。
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引用文獻(xiàn)：
Hannus M. et. al.: siPools: highly complex but accurately defined siRNA pools eliminate off-target effects. Nucleic Acids Res 42(12): 8049-61(2014)
Marine S. et. al.: Common Seed Analysis to Identify Off-Target Effects in siRNA Screens. Journal of Biomolecular Screening 1-9 (2011)
Jackson A. et. al.: Expression Profiling reveals off-target gene regulation by RNAi. Nature Biotechnology (2003)
