許多技術人員以及真正的使用操作人員容易將全自動水質采樣器與水質留樣器混淆。的確，在使用過程中有很多的功能兩者是可以混用的，不存在嚴格的界限區分，但從我們廠家的角度來說這個還是比較容易區分的。

　　全自動水質采樣器主要用來進行主動的水樣采取，比較側重于“采”的過程，因此廠家在研發設計過程中應考慮如何更方便于用戶進行移動、攜帶，畢竟外出水樣采集不可能攜帶體積較大的儀器，只要能滿足基本的采樣需求即可，當然在易于攜帶、移動的同時會將更多的功能加裝在采樣器上面比如恒溫冷藏、分瓶采樣、水樣保護等等，它主要應用于現場水樣采集的環保、高校科研單位的水樣采集化驗實驗、各類企業的不定期的水樣采集檢驗等等。

　　留樣器主要強調的是“留”的過程，即是將不合格的或者不滿足要求的水樣進行留存，方便進行水樣的再次化驗檢測。因此留樣器的要求相比較采樣器的易于移動、攜帶等特點要高很多，多應用于固定的環境監測板房、環境監測站、企業污廢水排放的實時監控等。首先，留樣器必須能夠實現給在線水質監測儀器（在線COD監測儀、在線氨氮監測儀等）無間斷提供水樣，即在線監測儀器所需的用來檢測的水樣是來自留樣器提供，因此必須保證留樣器24小時*365天全天候處于工作狀態；其次，留樣器必須能夠滿足與在線監測儀器進行即時的通訊，可以根據在線儀器發出的信號進行實時的動作，以保證留取水樣具有代表性；再次，留樣器必須能夠實現對水樣的全面防護，除恒溫冷藏保證留存水樣不變質外，還應該設有各種門鎖開關等，防止對水樣進行非法操作，使水樣失去代表性；后，留樣器還應易于維護，超長時間連續的工作會對儀器自身造成疲勞老化，而更換、維修零部件在所難免，根據監測站對水樣實時監控的監控原則，不允許在儀器維護方面耗費大量時間，因此儀器必須易于更換檢修等。

　　總體來講，全自動水質采樣器與留樣器之間還是存在較大差異的，要根據具體的應用場所以及應用需求進行合理的選擇，這樣既能節省成本又可實現對儀器的利用