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關于固相多肽合成這些雷你都避開了嗎?

來源:岐昱實業(上海)有限公司   2023年08月04日 14:11  


正是因為固相多肽合成如此“好用",自1920年多肽藥物胰島素問世以來,多肽藥物就重塑了在現代制藥領域的地位。在過去的20多年里,將近有近超過60種多肽類藥物獲得批準。根據一項多肽行業的數據分析,2016年至2024年多肽治療的年增長率將達到9.1%。多肽行業的發展,除了固相多肽合成技術的進步之外,現實的需求也很強勁,比如代謝疾病和癌癥發病率持續增加,需要更多多肽藥物來進行治療。當然,需求大,自然來錢多,治療代謝性疾病的多肽類藥物,例如(Victoza)和類胰高血糖素肽1(GLP-1)每年至少有20億美元的銷售額[1]。

咱們今天就來聊聊多肽藥物制備的那些事兒。



多肽藥物制備二三事

多肽泛指2~100個氨基酸經肽鍵連接形成的化合物,多肽藥物具有生物活性高,特異性強,副作用小等特點。
從合成角度看,多肽藥物的制備主要有化學合成、基因重組及天然提取三種方法,其中固相化學合成多肽技術擁有產率佳,純度高,質量穩定,環境友好等優勢,被廣泛應用于3~50個序列的多肽原料藥生產。


也正是因為固相多肽合成如此“好用",自1920年多肽藥物胰島素問世以來,多肽藥物就重塑了在現代制藥領域的地位。在過去的20多年里,將近有近超過60種多肽類藥物獲得批準。根據一項多肽行業的數據分析,2016年至2024年多肽治療的年增長率將達到9.1%。多肽行業的發展,除了固相多肽合成技術的進步之外,現實的需求也很強勁,比如代謝疾病和癌癥發病率持續增加,需要更多多肽藥物來進行治療。當然,需求大,自然來錢多,治療代謝性疾病的多肽類藥物,例如(Victoza)和類胰高血糖素肽1(GLP-1)每年至少有20億美元的銷售額[1]。

咱們今天就來聊聊多肽藥物制備的那些事兒。



多肽藥物制備二三事

多肽泛指2~100個氨基酸經肽鍵連接形成的化合物,多肽藥物具有生物活性高,特異性強,副作用小等特點。
從合成角度看,多肽藥物的制備主要有化學合成、基因重組及天然提取三種方法,其中固相化學合成多肽技術擁有產率佳,純度高,質量穩定,環境友好等優勢,被廣泛應用于3~50個序列的多肽原料藥生產。
那么厲害的固相多肽合成,了解一下
(1) 有保護基氨基酸的脫保護反應;
(3) 偶聯反應-形成酰胺鍵并合成最終的多肽。






 






這類雜質源于在氨基酸上接入Fmoc基團的試劑和已經成形的Fmoc-氨基酸發生副反應。二肽雜質存在會導致目標氨基酸重復插接。



圖2 二肽雜質

β-丙氨酰類雜質




游離氨基酸源于氨基酸與Fmoc試劑的不反應。游離氨基酸存在會導致多個目標氨基酸重復插接肽鏈,導致Fmoc基團在Fmoc-氨基酸衍生物儲存過程中自動催化裂解。
毫無疑問,這些雜質都會大大降低固相多肽合成的產率和純度,增大提純難度。
多肽合成中的“隱藏殺手":乙酸
相比于氨基酸骨架的雜質,乙酸則更像是固相多肽合成的“天敵"。由于分子量小且也會被活化劑活化,具有高反應活性,即便痕量乙酸也會在固相合成過程中截斷延伸的肽鏈。
有很多人覺得一點點乙酸,無關緊要。那咱們來做個數學題:



Fmoc-Arg(Pbf)-OH受到低至0.1%的乙酸污染,就相當于1mol%的乙酸污染。但如果考慮到通常試劑用量會超出5倍,而高反應活性乙酸會先于氨基酸與肽段結合,則每次循環會造成高達5%的鏈終止。如果合成的多肽含有3%的殘基,則意味著15%的鏈會終止。



圖4 乙酸對合成多肽的影響

下圖是實例展示。僅僅0.1%的乙酸污染對于21 mer多肽合成的影響;截斷的副產物采用“*"表示。



圖5 含有乙酸合成多肽的HPLC譜圖

Fmoc-氨基酸中的乙酸很難檢測,默克專門開發了標準Fmoc-氨基酸中乙酸定量的方法。
跟所有工業產品一樣,氨基酸原料的純度也存在批次差異。這里有個規律,純度越高,差異性就越小。



多肽批次間差異



談完原料,可以說說多肽了。



序列相同的多肽,不同批次間存在差異,這個無法避免。序列不同的多肽,本身的性質也有差異,比如聚集 – 疏水性多肽的濃度越高,聚集也越高,活性主要取決于聚集形態下的活性。



此外,穩定性也很重要。多肽在儲存過程中會有化學轉變。比如含有Asp-Gly的多肽導致形成iso-Asp,多肽中的Cys通過形成二硫鍵而交聯以及Met氧化成亞砜和焦形成。這些雜質有可能帶有細胞毒性,比如二硫蘇糖醇(DTT)。



除了純度之外,多肽的穩定性跟儲存有關,凍干狀態常比溶液更穩定;再一個影響穩定性的因素就是氨基酸組成和序列,所謂sequence depends!



下面是幾個典型的組成和序列導致的穩定性降低。


水解:含Asp (D)的多肽的常見問題。含有Asp-Pro (D-P)或Asp-Gly (D-G) 組合的多肽容易脫水,形成環狀亞胺中間體。另外,含有Ser (S) 的序列也可能形成可切割肽鏈的環狀亞胺中間體。





氧化:Cys (C)和Met (M)殘基是發生可逆氧化的主要氨基酸。殘基發生氧化后形成亞砜和/或砜,很難逆轉。



二酮和焦形成:二酮形成通常發生在(G)位于N末端第3位點時,Pro (P)或Gly (G)位于第1或第2位點時更易發生。如果Gln (Q)位于序列的N末端位點,則焦形成幾乎是不可避免的。這種轉變也可能發生在N末端位點含有Asn (N)的多肽序列中,但可能性較小。



歸根到底,想要高質量的多肽產品,就一定需要高品質的原料和試劑。







END






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