(1)、色譜長度和填料的性質，色譜柱越長，組分之間分辯效果越好，但色譜柱越長壓降越大，而輸入的壓力是有限的。色譜柱過長會增大進出口壓力比，相反會降低分離度。
(2)、色譜柱填料顆粒大小也是主要因素，粒子越細，由于表面積增加，分辯效果越好，但是顆粒細會增大柱壓降，也會起反作用。
(3)、柱溫對分辯效果也有很大影響，因為氣體在液體中的溶解度或在固體表面的吸附程度都隨溫度增高而降低，在氣液色譜分析中，當超過一定溫度時，靜態的液體通常會從色譜柱中揮發掉，所以選擇柱溫時應考慮到樣品的沸點。一般是略低于樣品沸點的平均值。
(4)、載氣種類的影響。常用的載氣有N2、H2、He、Ar等，其中H2、He氣的分子量較小，有利于提高分析速度，但濃度較高的介質易在其間形成擴散，影響分離度，所以在實際測量中H2、He氣體一般都用在介質濃度較低的區域并提高其流速，減少擴散的影響。N2、Ar等分子量較大的氣體的優點是擴散作用小，缺點是在柱中壓降大流速慢，即分析周期長。
(5)、載氣流速的影響。介質在固定相上的滯留時間，主要取決于介質自身的特性(揮發性，極性等)和載氣的流速。所以流速快慢直接影響分離度。
(6)、進樣時間和進樣量的影響。進樣時間應盡量短，原則上的瞬間進樣會提高分離度。進樣量應盡量小，但應使檢測器能夠識別。
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