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實(shí)驗(yàn)室制備的人源細(xì)胞為何會(huì)失敗?

來源:上海莼試生物技術(shù)有限公司   2017年08月17日 11:09  

誘導(dǎo)多能人源細(xì)胞為再生醫(yī)學(xué)帶來了希望,因?yàn)閺睦碚撋险f,它們可以變成任何類型的組織,并且,因?yàn)樗鼈兪怯刹∪俗陨淼某扇思?xì)胞制成,因此保證了兼容性。然而,將成人細(xì)胞變成這些iPS細(xì)胞的技術(shù),并非*,在恢復(fù)它們的多能狀態(tài)之后,這些細(xì)胞并不總是能正確地分化恢復(fù)到成年細(xì)胞。
現(xiàn)在,研究人員發(fā)現(xiàn)了其中一個(gè)原因:逆轉(zhuǎn)過程并不總是*捕獲一個(gè)細(xì)胞的基因組被折疊進(jìn)其細(xì)胞核的方式。這個(gè)折疊結(jié)構(gòu)直接影響基因的表達(dá),從而影響細(xì)胞的功能。
這項(xiàng)新的研究表明,當(dāng)前技術(shù)可能不會(huì)產(chǎn)生相當(dāng)于胚胎中發(fā)現(xiàn)的多能干細(xì)胞那樣的iPS細(xì)胞,因?yàn)橐恍┛寺”A舻恼郫B模式,部分類似于成年細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的模式。
這項(xiàng)研究指出了將這些折疊錯(cuò)誤zui小化的方法。雖然將成人干細(xì)胞轉(zhuǎn)化回iPS細(xì)胞的技術(shù)已經(jīng)存在了十年,并避免了圍繞著“使用胚胎干細(xì)胞”出現(xiàn)的問題,這些問題阻礙了這些細(xì)胞的再生醫(yī)學(xué)研究,因此臨床調(diào)查一直是謹(jǐn)慎而緩慢的。iPS細(xì)胞可能無法正確地分化成所需的組織。此外,也有人擔(dān)心由此產(chǎn)生的組織可能有不可預(yù)見的基因異常,或可能癌變。
即使在臨床應(yīng)用以外,許多研究人員感興趣的是,iPS細(xì)胞作為生成“培養(yǎng)皿疾病”的一種方式。研究人員不是從一名遺傳疾病患者身上采集組織樣本——當(dāng)受影響的器官是大腦時(shí),這是特別具有挑戰(zhàn)性的,而是可以利用來自患者皮膚細(xì)胞的iPS細(xì)胞,制備所需的模型器官。觀察這些組織的發(fā)展,可以提供關(guān)于疾病進(jìn)展的線索,以及作為治療的理想試驗(yàn)平臺(tái)——沒有批準(zhǔn)用于人類。
然而,在臨床和研究應(yīng)用中,允許產(chǎn)生“高質(zhì)量”iPS細(xì)胞的特性,能夠正確分化成所需的組織,而沒有不清楚的基因異常。
我們知道,在基因組拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和基因表達(dá)之間有一種,這激勵(lì)著我們探索,在成熟腦細(xì)胞重編程為多能性的過程中,遺傳物質(zhì)在細(xì)胞核內(nèi)的三維空間中是如何被重新配置的。
Phillips-Cremins的研究領(lǐng)域是“3D表觀遺傳學(xué)”,或DNA折疊影響基因表達(dá)的方式。經(jīng)典的表觀遺傳標(biāo)記是DNA序列上的化學(xué)修飾,提供了長(zhǎng)序列堿基配對(duì)字母上的另一層信息。然而,人源細(xì)胞以線性方式研究這些標(biāo)記,并不能揭示整個(gè)畫面,因?yàn)榛蚪M折疊可能使DNA的兩個(gè)不同區(qū)域,產(chǎn)生空間和功能上的。
Beagan用于創(chuàng)建高分辨率圖像的方法,包括修復(fù)DNA,這樣其三維折疊模式在測(cè)序之前得以保存。線性基因序列的部分,明顯被標(biāo)記的距離所分開,但是當(dāng)DNA被化學(xué)粘合在一起時(shí),它們?cè)诳臻g上是相鄰的。因此,線性序列兩個(gè)遙遠(yuǎn)的部分,zui終將以一串相同的混合DNA字符結(jié)束,從而在DNA測(cè)序時(shí)被一起發(fā)現(xiàn)。
分析這些混合片段提供的信息,可允許研究人員推斷出,哪些在基因組折疊狀態(tài)中相互毗鄰。至關(guān)重要的是,Cremins實(shí)驗(yàn)室的方法,只靶定基因組中的特定位點(diǎn),這使得研究人員更容易實(shí)現(xiàn)這些區(qū)域之間的高分辨率分析,而不是用替代的全基因組方法。
Dimethylacrylshikonin    β,β-二甲基丙烯酰紫草素    24502-79-2    20mg
Isochlorogenic acid A    異綠原酸A    2450-53-5    20mg
Gardenoside    梔子苷    24512-62-7    20mg
Geniposide    京尼平甙; 梔子甙    24512-63-8    20mg
Senegenin    遠(yuǎn)志皂苷元    2469-34-3    20mg
Leonurine hydrochloride    鹽酸益母草堿    24697-74-3    20mg
人源細(xì)胞

 

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