ToneScript cDNA*鏈合成試劑盒是專門用于兩步法RT-PCR的*步,含有合成高質量*鏈cDNA所需的所有成分,適用于后續的PCR、qPCR以及基因克隆。那么在實際操作中會有哪些常見問題呢?一起來了解一下:
1、 沒有RT-PCR產物或產量低
◆RNA模板降解。RNA 的純度和完整對于反轉錄得到全長cDNA是非常重要的。提取的RNA應進行電泳檢測以確定其是否降解。同時RNA要避免多次反復凍融。
◆RNA模板純度低。提取RNA的過程中,可能殘留一些鹽離子、試劑,如 EDTA、酚、胍鹽、磷酸鹽、多胺等抑制接下來的反轉錄反應。建議用75%乙醇(DEPC 水配制)仔細清洗RNA沉淀。
◆引物不合適。選擇合適的引物,當RNA是細菌RNA或者是沒有polyA尾的RNA要選擇隨機引物或者特異引物。
◆目的基因含有復雜二級結構或高GC含量。建議選擇隨機引物進行反轉錄。將反轉錄溫度提高至55℃。
2、RT-PCR 產物比預期長
◆RNA 中很可能污染了DNA。真核生物基因組DNA中含有內含子,可能參與了 PCR擴增,可以在反轉錄之前對RNA進行DNaseI的消化。
3、陰性對照中有RT-PCR產物
◆陰性對照中有RT-PCR產物也表明有DNA的污染。在反轉錄之前對RNA進行DNase I 的消化。
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