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2.細胞通透與封閉：用預熱的封閉通透液（40ml PBS+120ul TritonX-100+400ul 30%H2O2）浸潤切片30min（RT 避光），降低內源性過氧化物酶的活性。PBS洗3次，3 min/次。
3.抗原修復：由于制作石蠟切片時，甲醛固定使得蛋白之間交聯及醛基的封閉作用從而失去抗原性，這一步就是讓胞內的抗原決定簇重新“滿血復活"。
比較常用的是微波修復，pH 6.0的0.01M檸檬酸鈉緩沖液浸泡切片，在微波爐里高火4min至沸騰后，取出自然冷卻至室溫，重復2次，每次補足液體以免干片。（當然有的朋友用酶修復法也是可以的）。PBS洗3次，3 min/次。
4.血清封閉：用與二抗同一來源的血清封閉一些非特異性結合位點。此時可用油性筆圍繞組織畫圈，并對圈內的組織滴加稀釋好的血清，37℃溫箱中30min,用濾紙吸去多余的血清。
5.孵育一抗：對圈內的組織（面積為1×1）滴加稀釋好的一抗20ul，4℃過夜或者37℃ 1-2h。PBS洗3次，3 min/次。（一般4℃過夜后，需要將切片放置37℃復溫45min，防止脫片以及可使抗原抗體結合的更穩定）
6.孵育二抗：對圈內的組織（面積為1×1）滴加稀釋好的二抗20ul，37℃ 1-2h，PBS洗3次，3 min/次。
7.切片顯色：用DAB-H2O2顯色10min，顯色液最好是現用現配，此時要通過顯微鏡觀察染色是否明顯，10min內即可用蒸餾水終止顯色。
8.復染及封片：為了形成細胞輪廓，更好的定位目標蛋白，可用Mayer蘇木素染色30s，水洗，鹽酸酒精分化2s，流水浸入15min。脫水時，乙醇梯度（由低至高：50%、70%、95%、100%）各2min。二甲苯5min使切片透明化，最后加入中性樹膠封片（一般封片后最好立即拍照，若不能及時拍照，可用指甲油封固并保持好避光和濕度）。
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