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當(dāng)前位置:上海撫生實(shí)業(yè)有限公司>>公司動(dòng)態(tài)>>上海有機(jī)所等揭示真菌非核糖體肽大環(huán)環(huán)合的結(jié)構(gòu)機(jī)制
他類elisa定量檢測(cè)試劑盒由細(xì)菌或真菌通過(guò)自身代謝合成的天然多肽化合物,例如*、*、棘白霉素類化合物等,許多都具有抗菌或抗腫瘤活性,是國(guó)內(nèi)外新藥創(chuàng)制的重要源泉。它們的生物合成途徑分為兩類,一類通過(guò)核糖體來(lái)源的多肽進(jìn)行縮合、修飾及環(huán)合,另一類則通過(guò)一種具有高度模塊化特征的非核糖體多肽合酶(nrps)將天然或非天然的氨基酸逐一組裝起來(lái),這種工作機(jī)制兼具性和靈活的特異性,保證了天然多肽產(chǎn)物結(jié)構(gòu)的多樣性。對(duì)細(xì)菌和真菌非核糖體多肽合酶的組裝、結(jié)構(gòu)和催化機(jī)制研究,有助于深入了解天然多肽化合物的生物合成機(jī)制,并使通過(guò)組合生物合成手段獲得更多有生物活性的多肽化合物成為可能。
早期的研究表明:細(xì)菌來(lái)源的nrps途徑鏈狀多肽產(chǎn)物的釋放與環(huán)合是通過(guò)硫酯酶(thioesterase,te)完成的,而真菌nrps則經(jīng)常由一個(gè)類似于縮合結(jié)合域的來(lái)控制多肽產(chǎn)物生物合成的終止與環(huán)合。為了從分子機(jī)制上闡明域如何在控制真菌nrps生物合成終止過(guò)程發(fā)揮作用,國(guó)*上海有機(jī)化學(xué)研究所生命有機(jī)化學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的周佳海研究團(tuán)隊(duì)分別解析了(1.8埃分辨率)和處于活化狀態(tài)的t-ct復(fù)合物(2.49埃分辨率)的晶體結(jié)構(gòu),發(fā)現(xiàn)經(jīng)典縮合結(jié)構(gòu)域的一段n端環(huán)狀區(qū)域被能域相應(yīng)的α1螺旋所取代,并導(dǎo)致α2螺旋向活性口袋鄰近的接納位點(diǎn)靠近(見下圖),從而阻滯了與域相連的底物上載到接納位點(diǎn)上進(jìn)行新一輪的肽基延伸反應(yīng)。
t-ct復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)揭示一旦域被活化后,磷酸泛酰巰基將參與穩(wěn)定t與ct的相互作用,并從域活性口袋的一側(cè)接納線狀多肽產(chǎn)物,完成終環(huán)狀多肽產(chǎn)物的合成與釋放。這不僅解釋了真菌nrps中能域?yàn)楹伪仨氁蕾嚹苡虿虐l(fā)揮作用,也為通過(guò)合理設(shè)計(jì)來(lái)產(chǎn)生不同大小與結(jié)構(gòu)的新型大環(huán)多肽天然產(chǎn)物提供了技術(shù)藍(lán)圖。
該課題是與美國(guó)加州大學(xué)洛杉磯分校教授yitang和中科院武漢數(shù)學(xué)物理研究所研究員唐淳合作完成的,得到了國(guó)家自然科學(xué)基金委面上項(xiàng)目和上海市科委項(xiàng)目的資助,晶體衍射數(shù)據(jù)分別在國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)(上海)研究中心的bl19u1、上海光源的bl17u1及日本光工廠的bl線站收集。
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