在醫療、或制藥等實驗中都離不開離心機，其使用過程中對環境的要求很高，無論是非無菌環境還是無菌環境，比如在無菌車間，就有萬級、十萬級等車間，良好的密閉性能可使得外部與機器內部保持有效的隔離。內腔中的固、液、氣相不能與操作員、外部產生污染。
如何做到不污染環境，制造商應對離心機的密閉性能進行改進設計，并在生產時充分體現，
機蓋的密封：機蓋因是可翻式，與殼接處面應有可靠的密封措施，若因密封配件防腐失效，就可能造成液、氣相的泄漏，對環境、人員造成傷害。
軸承位的密封：對于主軸螺母、軸承位的密封，以前的傳統機型在這方面的密封措施比較簡易，如氣相滲入，對主軸錐面產生腐蝕，甚至滲入軸承中，對軸承產生破壞，從而影響機器的正常使用。上軸承蓋一般都設置骨架式密封等結構，但上軸承蓋與轉鼓錐孔之間的一部分則暴露在外，離心機內腔中的氣相，則可能對主軸暴露面產生腐蝕。制藥行業所用的離心機，其所分離的物料中大都有機溶劑或酸、堿、鹽等介質，因此在訂購設備時應充分考慮到這些部位的密封要求，
主要是從安全角度出發，以提高其使用安全性，但對于磨擦所產生的粉塵對環境的污染則沒有加于控制，如在潔凈區內使用是不可行的。因此，必須對傳動帶工作區域密閉起來，以防止磨擦粉塵的外泄。
其它部位；密封槽結構（出液管、進料管、出料斗等接口部位）：對于離心機的外接管道，一般情況下選用法蘭安裝方式，以確保其接口的密封性能，使得無菌車間環境更潔凈。
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