ATCC細(xì)胞膜包著的黏稠透明的物質(zhì)，叫做細(xì)胞質(zhì)。在細(xì)胞質(zhì)中還可看到一些帶折光性的顆粒，這些顆粒多數(shù)具有一定的結(jié)構(gòu)和功能，類似生物體的各種器官，因此叫做細(xì)胞器。例如，在綠色植物的葉肉細(xì)胞中，能看到許多綠色的顆粒，這就是一種細(xì)胞器，叫做葉綠體。綠色植物的光合作用就是在葉綠體中進(jìn)行的。在細(xì)胞質(zhì)中，往往還能看到一個(gè)或幾個(gè)液泡，其中充滿著液體，叫做細(xì)胞液。在成熟的植物細(xì)胞中，液泡合并為一個(gè)中央大液泡，其體積占去整個(gè)細(xì)胞的大半。細(xì)胞質(zhì)被擠壓為一層。細(xì)胞膜以及液泡膜和兩層膜之間的細(xì)胞質(zhì)稱為原生質(zhì)層。

線粒體（mitochondrium）線粒體是一些線狀、小桿狀或顆粒狀的結(jié)構(gòu)。在活ATCC細(xì)胞中可用詹納斯綠（Janus green）【anus Green B 別名：健那綠 化學(xué)式：C30H31N6Cl 詹納斯綠B是一種活體染色劑，專一用于線粒體的染色。它可以和線粒體中的細(xì)胞色素C氧化酶結(jié)合，從而出現(xiàn)藍(lán)綠色。】染成藍(lán)綠色。在電子顯微鏡下觀察，線粒體表面是由雙層膜構(gòu)成的。內(nèi)膜向內(nèi)形成一些隔，稱為線粒體嵴（cristae）。在線粒體內(nèi)有豐富的酶系統(tǒng)。線粒體是細(xì)胞呼吸的中心，它是生物有機(jī)體借氧化作用產(chǎn)生能量的一個(gè)主要機(jī)構(gòu)，它能將營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)（如葡萄糖、脂肪酸、氨基酸等）氧化產(chǎn)生能量，儲(chǔ)存在ATP（三磷酸腺苷）的高能磷酸鍵上，供給

細(xì)胞其他活動(dòng)的需要，因此有人說(shuō)線粒體是細(xì)胞的“動(dòng)力工廠”。根據(jù)對(duì)線粒體機(jī)能的了解，近些年來(lái)試驗(yàn)用“線粒體互補(bǔ)法”進(jìn)行育種工作，即將兩個(gè)親本的線粒體從ATCC細(xì)胞中分離出來(lái)并加以混合，如果測(cè)出混合后呼吸率比兩親本的都高，證明雜交后代的種優(yōu)勢(shì)強(qiáng)，應(yīng)用這種育種方法，能增強(qiáng)育種工作的預(yù)見(jiàn)性，縮短育種年限。