丙型肝炎病毒(HCV)核酸檢測試劑盒(PCR-熒光探針法)反應(yīng)流程常規(guī)程序:

將PCR反應(yīng)所需的成分配置完后，在PCR儀上于94-96℃預(yù)加熱幾十秒至幾分鐘，使模板DNA充分變性，然后進(jìn)入擴(kuò)增循環(huán)。在每一個(gè)循環(huán)中，先于94℃保持30秒鐘使模板變性，然后將溫度降到復(fù)性溫度（一般50-60℃之間），一般保持30秒鐘，使引物與模板充分退火；在72℃保持1分鐘（擴(kuò)增1kb片段），使引物在模板上延伸，合成DNA，完成一個(gè)循環(huán)。重復(fù)這樣的循環(huán)25～35次，使擴(kuò)增的DNA段大量累積。最后，在72℃保持3-7min，使產(chǎn)物延伸完整，4℃保存。

2．復(fù)性（退火）和延伸溫度

復(fù)性的溫度是PCR擴(kuò)增是否順利的關(guān)鍵因素，通常在50-60℃之間。具體的溫度主要由引物的Tm值決定。延伸溫度絕大多數(shù)設(shè)定為72℃。如果復(fù)性的溫度很高，可以將延伸溫度和復(fù)性溫度設(shè)置成同一溫度，變成二步法PCR。

3．反應(yīng)時(shí)間

變性步驟一般使用30秒鐘，如果模板的G+C含量較高，或直接用細(xì)胞做模板，變性時(shí)間可適當(dāng)延長。復(fù)性時(shí)間有30秒種一般是足夠的。延伸時(shí)間由擴(kuò)增產(chǎn)物的大小決定，一般采用1kb用1分鐘來保證充足的時(shí)間。

4．循環(huán)次數(shù)

循環(huán)次數(shù)主要與模板的起始數(shù)量有關(guān)，在模板拷貝數(shù)為104～105數(shù)量級(jí)時(shí)，循環(huán)數(shù)通常為25～35次。

平臺(tái)效應(yīng)（plateaueffect）：PCR擴(kuò)增過程后期會(huì)出現(xiàn)的產(chǎn)物的積累按減弱的指數(shù)速率增長的現(xiàn)象。原因：底物和引物的濃度已經(jīng)降低，dNTP和DNA聚合酶的穩(wěn)定性或活性降低，產(chǎn)生的焦磷酸會(huì)出現(xiàn)末端產(chǎn)物抑制作用，非特異性產(chǎn)物或引物的二聚體出現(xiàn)非特異性競爭作用，擴(kuò)增產(chǎn)物自身復(fù)性，高濃度擴(kuò)增產(chǎn)物變性不*。

5．PCR反應(yīng)液的配制

PCR反應(yīng)體系的配置方式有時(shí)也會(huì)影響反應(yīng)的正常進(jìn)行。常規(guī)方法與其它酶學(xué)反應(yīng)一樣，在最后加入DNA聚合酶。早期的PCR儀沒有帶加熱的蓋子，要求在反應(yīng)液上覆蓋一層礦物油，防止水分蒸發(fā)。

對(duì)于使用具3’-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時(shí)，有時(shí)會(huì)擴(kuò)增不出產(chǎn)物。在遇到這個(gè)問題時(shí)，如果將反應(yīng)成分分開配制，A管含模板、引物和dNTP，以及調(diào)整體積的H2O，B管含緩沖液、DNA聚合酶和水，然后再將兩管溶液混合起來，可較好地克服這個(gè)問題。

按照常規(guī)的方法配制反應(yīng)體系，有時(shí)會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增的問題。熱啟動(dòng)（hotstart）PCR操作方式可較好解決這一問題。將dNTP、緩沖液，Mg2+和primer先配制好，然后加入一粒蠟珠（如AmpliWaxPCRQam100），加熱熔化，再冷卻，使蠟將溶液封住，最后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有當(dāng)PCR反應(yīng)進(jìn)入高溫階段后，蠟層熔化，所有反應(yīng)成分才會(huì)混合在一起。

人結(jié)直腸腺癌細(xì)胞；LS 174T [LS174T]

人乳腺癌細(xì)胞；MDA-MB-468

人肺支氣管癌細(xì)胞；NCI-H1650

人非小細(xì)胞肺腺癌細(xì)胞；NCI-H1975

人非小細(xì)胞肺腺癌細(xì)胞；NCI-H2087

人小細(xì)胞肺癌；NCI-H2227

人非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞；NCI-H23

人腎上腺皮質(zhì)腺癌細(xì)胞；NCI-H295R

小鼠源細(xì)胞

小鼠胚胎成纖維細(xì)胞；3T3-Swiss albino

小鼠T淋巴細(xì)胞瘤細(xì)胞；Cyc-Tag(S49)

小鼠骨髓細(xì)胞；FDC-P1

小鼠垂體瘤細(xì)胞；GT1-1

小鼠胚胎成骨細(xì)胞前體細(xì)胞；MC3T3-E1

小鼠胚胎成纖維細(xì)胞；NIH/3T3

小鼠睪丸畸胎瘤細(xì)胞；P19

小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(來自NIH3T3)；PA12

小鼠血細(xì)胞；WEHI-3 [WEHI3]

小鼠成纖維細(xì)胞；φ2

小鼠紅白血病細(xì)胞；MEL

小鼠骨髓瘤細(xì)胞；Sp2/0-Ag14

小鼠垂體瘤細(xì)胞(分泌促生長激素分泌激素)；AtT-20

小鼠小膠質(zhì)細(xì)胞；BV2

小鼠骨髓瘤細(xì)胞；Fox-NY

小鼠胚胎成纖維細(xì)胞；MEF

小鼠淋巴瘤細(xì)胞(NK靶細(xì)胞)；YAC-1

野生型人c-kit受體細(xì)胞株；A7d

小鼠原B細(xì)胞株；BaF3

小鼠腦瘤細(xì)胞；BC3H1

小鼠成肌細(xì)胞；C2C12

小鼠肝癌細(xì)胞；Hepa 1-6 [Hepa1-6]

小鼠肥大細(xì)胞瘤細(xì)胞；P815

小鼠胚胎成纖維細(xì)胞；3T6-Swiss albino

小鼠胚胎成纖維細(xì)胞；C3H 10T1/2 2A6

小鼠樹突狀細(xì)胞肉瘤細(xì)胞；DCS

小鼠淋巴瘤細(xì)胞；EL4

小鼠前胃癌細(xì)胞；MFC