為了正確選擇和根據實際情況紫外線消毒器系統，必須先確定哪些病原體需要被滅活。不同病原體對紫外線具有不同的抵抗力，某些病原體比其它病原體更容易受到紫外線的影響；因此，為了滅活不同的病原體，就需要不同的短波紫外線接觸量。 “滅活"的真正含義是什么？難道它意味著，每一個病原體一旦經過紫外線消毒器系統，就會被滅活嗎？實際上，這并不可能。事實上，不管采用哪種消毒方法（紫外線殺菌器消毒、氯消毒、臭氧消毒或其他消毒方法），都無法滅活所有的病原體。消毒系統能做到的是使病原體的數量減少一個可預計的數量，可以認為達到安全范圍內。這種可預計的數量被稱為“log"減少量（如同“對數"減少量）。“一個log"（通常稱為“1 log"）的減少量是指流入的目標病原體數量減少90%。2 log減少量指減少量為99%，3 log減少量為99.9%，依此類推。為了滅活各種不同的病原體，使其數量減少一定的對數（log）減少量，科學家們計算出了所需的紫外線接觸量。

到目前為止，為滅活病原體而輸出的短波紫外線能量被稱為“紫外線接觸量"。實際上，這種接觸量的正確術語是“紫外線劑量或紫外劑量"，而更準確的術語是“紫外線作用量"。此外，圖4所示的紫外線作用量與對數減少量的關系，被描述為病原體的“劑量響應曲線"。由于人們zui常使用“紫外線劑量"來表達紫外線接觸量，所以在后面的討論中也使用這一術語。

需要注意的是，從圖4可以看到，被滅活病原體的對數減少量與所需的紫外線劑量之間很少出現線性關系。人們常犯的一個錯誤就是，先查得1 log滅活量所需的紫外線劑量，然后用這個劑量簡單乘以一個倍數，就以為可以計算出更高對數減少量所需的紫外線劑量。雖然大腸桿菌（一種很常見的病原體）的劑量響應曲線幾乎是線性的，但大多數病原體的并不是，所以用上面所說的方法，根據對數減少量來簡單計算紫外線劑量，得到的結果并不準確。

各國對紫外線消毒器輻射劑量的標準：

據研究殺滅90%的細菌的紫外光輻射劑量（在253.7nm波長測定，下同）為5mJ/cm2；殺滅99%的細菌的紫外光輻射劑量為15mJ/cm2；對于 大部分微生物采用40mJ/cm2的輻射劑量可獲得99.9%的殺滅效果。因此通常認為飲用水紫外線消毒器的紫外線輻射的zui小劑量可采用11~40mJ/cm2。某些用 途（如化妝品工業）的劑量可達90~120mJ/cm2.實際水處理工藝中采用的消毒劑量大多為40~140mJ/cm2.有研究者指出當消毒劑量大于 100mJ/cm2時，紫外線輻射有可能生成消毒副產物。

美國國家標準局和國家衛生基金會規定地表水澄清過濾后紫外線殺菌器的zui低輻射劑量為38mJ/cm2，作為其他處理工藝消毒紫外線殺菌器的zui低輻射劑量為16mJ/cm2（消毒zui大的水層厚度為7.6cm）；

挪威規定zui低輻射劑量為16mJ/cm2；

法國和荷蘭規定zui低輻射劑量為25mJ/cm2；

奧地利規定zui低輻射劑量為30mJ/cm2；

澳大利亞規定公共給水的消毒劑量為45mJ/cm2。

中華人民共和國建設部頒布的《生活飲用水紫外線消毒器行業標準》規定，裝備新燈管的紫外線殺菌器反應器的紫外線輻射劑量不低于12mJ/cm2，而正常運行工作中的飲用水紫外線消毒反應器的輻射劑量不低于9mJ/cm2。

對于框架明渠式污水紫外線消毒器反應器而言，在實踐中為了完成足夠快的消毒，所需的劑量為40W·h/m3水.

在選用各種紫外線消毒器輻射裝置時，要考慮整個紫外線殺菌器處理系統的處理要求。例如對于純水設備，常要求水通過紫外線消毒器后的電阻率的降低量低于0.5MΩ·cm（25°C）。

紫外線消毒器的紫外線劑量決定著紫外線消毒器反應器功率的大小，也決定著紫外線消毒器價格的高低，紫外線消毒器廠家只用選擇適用的紫外線劑量才能zui大程度的降低成本，降低紫外線消毒器價格，避免資源浪費和環境污染。