常用的多肽激素標志物主要有hCG，LH，FSH和TSH等，這四種糖蛋白激素均由一個共同的。亞單位和一個特異的臼亞單位組成。LH和hCG的p亞單位非常相似，這給建立其特異的測定方法帶來了麻煩。

雜交瘤技術帶來的單克隆抗體使得hCG及其亞單位的特異測定成為可能，但仍存在很多問題，一個主要的問題是，是否所建立的方法既能測定hCG又能測定hCGp，或二者要用分別的方法測定。二者用分別的方法測定在理論上*可以做到，但聯合測定有實際上的優點。目前大多數hCG測定方法既測定hCG又測定hCGp，由于它們有可能使hCGp測定偏高而使其標準化較為復雜，如果該測定方法用來測定hCGp與hCG之比；就會有問題。在孕婦該比例小于3％，但樣本在室溫中貯存會因為肽鏈的蛋白水解作用（nicking，刻痕）使hCG解離成亞單位。

hCG和hCG臼的刻痕形式尤其是出現于癌癥患者，但孕婦也有。由于二硫鍵的存在，刻痕形式的hCG的基本結構仍會保留，但對抗體的結合能力會有所降低。因此，HCG測定標準化的一個重要目的是確定hCG的分子形式和建立特異的測定方法，這就要求有不同形式的hCG純化標準品和參考測定方法。目前使用的第三代hCG標準品（1S）是用生物試驗校準的，單位（U）可溯源至第二和*代IS。hCGa和hCGp標準品的濃度也以U表示，盡管其缺乏hCG活性，1U的hCGa和hCGp標準品相當于其各自lrtg的量，比較之下，1 U的hCG約為0．1lp．g。

hCG／hCGp在臨床上有重要價值，該比率的計算應根據摩爾濃度。此外，hCG的hCGp亞單位的一個片段即所謂的核心片段（hCGpcf）常以較高濃度出現于孕婦尿中，在男性和非孕婦尿中的濃度則很低，但在各種癌癥患者尿中常見升高。該片段可能來自于hCG和hCGp在腎小管中的降解，根據血清hCGp水平與尿中hCGBc{水平之間的相關性，癌癥患者hCGpcf的增高可能是由于腫瘤組織表達hCGp所致。由于hCG臼cf可作為數種腫瘤的標志物，因此，其測定的標準化也是重要的。

由前所述，LH和hCG有高度的相似性，交叉反應難以*避免。因為在男性和非孕婦hCG的濃度很低，因此LH與hCG之間存在的交叉反應對LH的臨床實際測定影響不大，盡管如此，大多數試劑廠家仍致力于建立特異的LH測定方法。雖然在許多方法中hCG的交叉反應僅為0．01％～o．1％，但在臨床上的應用仍受局限。很小的交叉反應也可能會引起混淆，因為hCG水平在1 000～10 000U／L的孕婦將有一個約為10的明顯的LH水平。

hCG交叉反應的LH測定試驗通常要使用兩種單克隆抗體，既與LH亞單位反應也識別完整LH，因此，這些試驗也測定游離的p亞單位及其片段，由于正常情況下血清中沒有這些成分，故血清測定不會成為問題。使用單克隆抗體一個可能存在的問題是其不能測定蛋白抗原的遺傳變異體，LH的一個遺傳變異體表現出與單克隆抗體的免疫反應性明顯降低，這是由于編碼基因上的點突變導致出現了一個新的糖基化位點，于是增加的糖鏈封閉了相應的抗原決定簇。

臨床上常要求TSH的測定試驗有較好的測定下限，使得試劑廠家不斷發展具有更低測定下限的試驗，所謂的第二和第三代試驗已取代了*代放免試驗，第二代試驗的測定下限約為0．1～0．2U／L，第三代試驗約為0．01～0．02U／L。第三代試驗應能可靠地測定甲亢時出現的稍有異常的TSH濃度，從而使得TSH可作為甲狀腺功能的*線實驗。TSH試驗的標準化做得比較好，但在測定下限及低濃度測定的重復性上有時變異較大。而對于這種甲狀腺功能的*線實驗，應使用臨床樣本來評價其真正的測定下限。