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小量全血DNA提取方法

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小量全血DNA提取方法

 

儲存事項:
1. 結(jié)合液CB或者抑制物去除液IR低溫時可能出現(xiàn)析出和沉淀,可以在37℃水浴幾分鐘幫助重新溶解,恢復(fù)澄清透明后冷卻到室溫即可使用。
2. 為避免降低活性,方便運輸,提供蛋白酶K為凍干粉狀,收到后,可短暫離心后,加入1毫升滅菌水溶解。因為反復(fù)凍融可能會降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量(20微升)分裝凍存,-20℃保存。
3. 避免試劑長時間暴露于空氣中發(fā)生揮發(fā)、氧化、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時蓋緊蓋子。
? 操作步驟:(實驗前請先閱讀注意事項)
提示:*次使用前請先在漂洗液WB中加入量無水乙醇,充分混勻,加入后請及時在方框打鉤標(biāo)記已加入乙醇,以免多次加入!
1. 取200ul新鮮、冷凍或加入各種抗凝劑的血液,放入1.5ml離心管。
如果全血起始量小于200μl,則用緩沖液BB補足到200μl。如果起始量介于200μl-300μl之間,則后續(xù)操作需要按照比例增加試劑用量。如果起始量介于300μl-1ml之間,則需要*行紅細(xì)胞裂解操作(見本說明書后附錄)。
2. 加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,再加入200μl結(jié)合液CB,立刻渦旋振蕩充分混勻,在70℃放置10分鐘。溶液應(yīng)變清亮(但顏色偏黑色)。
可選步驟,一般不需要: 如果RNA殘留較多,需要去除RNA,可以在加入200μl 結(jié)合液CB 前加20μl RNase A(25mg/ml)溶液,振蕩混勻,室溫放置5-10分鐘。
3. 冷卻后加入100μl 異丙醇,立刻渦旋振蕩充分混勻,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀。
上述步驟中立刻渦旋或者吹打充分混勻非常重要,混勻不充分嚴(yán)重降低產(chǎn)量,必要時如樣品粘稠不易混勻時可以渦旋振蕩15秒混勻。
4. 將上一步混合物(包括可能有的沉淀)加入一個吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000 rpm離心30-60秒,倒掉收集管中的廢液。
5. 加入500μl抑制物去除液IR,12,000 rpm 離心30秒,棄廢液。
6. 加入700μl漂洗液WB(請先檢查是否已加入無水乙醇!),12,000 rpm 離心30秒,棄掉廢液。
7. 加入500μl漂洗液WB,12,000 rpm 離心30秒,棄掉廢液。
8. 將吸附柱AC放回空收集管中,13,000 rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。
9. 取出吸附柱AC,放入一個干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加100μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液事先在 65-70℃水浴中預(yù)熱效果更好), 室溫放置3-5分鐘,12,000 rpm 離心1分鐘。將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鐘,12,000 rpm離心1分鐘。
洗脫體積越大,洗脫效率越高,如果需要DNA濃度較高,可以適當(dāng)減少洗脫體積, 但是zui小體積不應(yīng)少于50μl,體積過小降低DNA洗脫效率,減少DNA產(chǎn)量。
10. DNA可以存放在2-8℃,如果要長時間存放,可以放置在-20℃。
? 附錄(以300μl,1ml全血舉例紅細(xì)胞裂解操作):
1. 吸取900μl紅細(xì)胞裂解液到一個1.5ml離心管或者3ml紅細(xì)胞裂解液到一個15ml離心管。(紅細(xì)胞裂解液可向本公司購買)
2. 將抗凝全血(使用前回復(fù)到室溫)顛倒混勻后,吸取300μl全血和1ml全血分別加到上述1.5ml和15ml離心管中,顛倒6-8次,并倒置輕彈管壁,確保充分混勻。
3. 室溫放置10分鐘(期間應(yīng)該顛倒輕彈混勻數(shù)次,幫助裂解紅細(xì)胞)。
4. 12,000 rpm離心20秒(對于1.5ml離心管)或2,000-3,000 rpm離心5分鐘(對于15ml離心管),倒棄紅色上清,并小心的盡可能多的吸棄上清(注意不要吸到管底的細(xì)胞團),留下完整的管底白細(xì)胞團和大約10μl的殘留上清。
離心后在管底應(yīng)該見到白色的白細(xì)胞團,也可能有一些紅細(xì)胞殘片和白細(xì)胞團在一起,但是如果看到的是大部分的紅色細(xì)胞團,說明紅細(xì)胞裂解很不充分,應(yīng)該再加入紅細(xì)胞裂解液重懸細(xì)胞團后重復(fù)步驟3,4。
5. 加入200μl緩沖液BB渦旋振蕩重懸白細(xì)胞團,充分分散白細(xì)胞團。
其中由于肝素抗凝血的白細(xì)胞沉淀團很難打散重懸,影響后續(xù)實驗裂解效果,建議選用非肝素的抗凝劑收集血液標(biāo)本。
 

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