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腫瘤基因組突變模式已確定,基因測序為癌癥研究提供重要線索

閱讀:71發布時間:2023-5-2

    通過篩選潛伏在 12,000 多個腫瘤基因組中的數億個突變,科學研究人員通過基因測序已經確定了 DNA 變化的模式,這些模式可以為癌癥的遺傳和環境原因提供了重要線索。

     這項研究是同類基因組研究中較具規模的。研究組人員在不斷增長的伴隨癌癥的“突變特征"目錄中添加了數十個條目,并且在某些情況下,有助于癌癥遺傳研究。

     西班牙巴塞羅那生物醫學研究所的計算癌癥生物學家揭示了基因組中無法從較小的數據集中挑選出來的罕見突變模式。當擁有擁較多全基因組時,就可以制造出一套完整的突變特征。目前基因組分析還處于早期階段,但它在診斷和了解這些腫瘤是如何產生的方面具有較大潛力。

基因突變

   單個癌細胞可能包含數十萬個突變,有時超過一百萬個,但其中只有少數會直接導致腫瘤的發展。多年來,研究人員一直在通過基因組數據 尋找這些癌癥驅動因素,希望他們能找到新的控制方法。

     許多剩余的“旁觀者"突變也可以提供信息。一些致癌劑會產生 DNA 變化的特征模式。例如,紫外線可以導致一個 DNA 堿基或“字母",稱為胞嘧啶,在基因組的某些位點被另一個稱為胸腺嘧啶的取代。這種變化經常出現在黑色素瘤中。

   在過去的一年中,科學家們分析了收集的腫瘤樣本的約 5,000 個全基因組序列,進行了基因測序,為腫瘤基因組突變特征研究奠定了堅實的基礎。

    在這項新研究中,該團隊分析了英國國家衛生服務局收集的 12,000 多個癌癥基因組,這些基因組是英國基因組學 100,000 基因組計劃的一部分。然后,研究人員使用之前發布的數據集來驗證他們的發現。這項數據驗證將涉及開發新的分析工具和能夠處理數十萬個突變的算法。

這項工作包括來自 19 種腫瘤類型的樣本產生了幾十個以前未知的突變足跡,其中一些可以追溯到修復 DNA 的特定細胞方法的缺陷。

     布達佩斯自然科學研究中心的癌癥生物學家研究人員現在可能已經發現了所有常見的突變特征。但隨著癌癥基因組項目在范圍內的蓬勃發展,尋找特定器官中不到 1% 的腫瘤中出現的罕見特征可能會繼續進行。

     除了尋找進一步的突變特征外,科研人員還希望能夠追蹤尚未與致癌事件相關的神秘的特征的起源。他們還想研究其他類型的基因變化:目前的研究重點是一到三個 DNA 字母的變化,但 DNA 序列也可以被刪除、插入或重新排列成較大的塊。

     研究人員梳理了代表 20 多種不同類型兒童癌癥的 1,700 多個腫瘤的基因組,進行基因測序以發掘潛在的藥物靶點,并更好地了解癌癥在年輕的患者中是如何發生的。總之,希望這些研究會影響到針對個體的癌癥控制。但從識別突變到開發有效藥物,還有很長的路要走。

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