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文章分享 | Ribo-seq與RNA-seq聯(lián)合分析揭示uAUG-ds翻譯調(diào)控機制2024/6/14

技術(shù)簡介RNA-seq主要從轉(zhuǎn)錄組水平分析基因的表達(dá)調(diào)控機制，檢測用于核糖體翻譯的RNA序列及二級結(jié)構(gòu)。Ribo-seq主要用于檢測核糖體翻譯的起始位置、翻譯富集區(qū)和翻譯終止位置。RNA-seq與Ri...

文章分享 | 基于翻譯組學(xué)技術(shù)揭示小麥籽粒發(fā)育過程中的翻譯調(diào)控機制2024/6/6

2023年發(fā)表在ThePlantCell上的“Thetranslationallandscapeofbreadwheatduringgraindevelopment”文章，發(fā)現(xiàn)了上游開放閱讀框（uOR...

楊樹miRNA在調(diào)控楊樹抗旱中的分子機制2024/5/28

2024年3月6日，林木遺傳育種全國重點實驗室、北京林業(yè)大學(xué)生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院尹偉倫與夏新莉教授課題組在NewPhytologist（中科院一區(qū)，影響因子9.4）期刊發(fā)表了題為“ThemiR6445-...

EMSA助力揭示楊樹扦插生根中LBD16介導(dǎo)通路的保守性2024/5/17

2023年6月15日，北京林業(yè)大學(xué)林金星研究組、李曉娟研究組，中國科學(xué)院徐麟研究組聯(lián)合在TheInnovationLife期刊上在線發(fā)表了題為“Transcriptomeframeworkofroot...

DAP-seq助力揭示GhRCD1促進(jìn)棉花對鎘的耐受調(diào)節(jié)機制2024/4/29

鎘（Cd2+）是環(huán)境中最常見的有害重金屬之一，嚴(yán)重威脅作物生產(chǎn)力和質(zhì)量以及食品安全。Cd2+容易被植物從土壤中吸收，并通過可食用的植物器官和谷物進(jìn)入食物鏈，對食品質(zhì)量、糧食安全和公共安全構(gòu)成威脅。植物...

DAP-seq助力揭示轉(zhuǎn)錄因子在草地貪夜蛾Bt抗性中重要作用2024/4/25

2024年4月6日，武漢生物工程學(xué)院生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院劉磊磊課題組在InternationalJournalofBiologicalMacromolecules（中科院一區(qū)，影響因子8.2）期刊在線發(fā)...

DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析助力揭示AvERF73參與調(diào)控低氧應(yīng)答和甲羥戊酸途徑2024/4/24

澇害（Waterlogging）是長期陰雨或暴雨后，由于地表積水，地面徑流不能及時排除，積水深度過大，時間過長，造成作物根部氧氣不足，并產(chǎn)生乙醇等有毒有害物質(zhì)，從而影響作物生長，甚至造成作物死亡，造成...

文章分享：應(yīng)用Ribo-seq技術(shù)量化tRNA對乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的調(diào)控2024/4/10

技術(shù)簡介Ribo-seq，又稱為RibosomeProfiling或者翻譯組測序，能夠?qū)εc核糖體結(jié)合并正在被翻譯的約30nt的mRNA片段進(jìn)行測序，詳細(xì)檢測體內(nèi)的翻譯狀態(tài)，Ribo-seq是連接轉(zhuǎn)錄組...

Ribo-seq：檢測正在翻譯的mRNA信息，連接轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)的橋梁2024/3/5

技術(shù)原理蛋白質(zhì)是生命活動的主要承擔(dān)者,翻譯調(diào)控又是細(xì)胞內(nèi)重要的調(diào)控方式。翻譯是核糖體讀取mRNA模板來指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成的過程,是基因表達(dá)的關(guān)鍵步驟。翻譯的過程受到嚴(yán)格的調(diào)控,很多疾病與翻譯異常相關(guān),比如...

DAP-seq鑒定BcERF070下游靶基因，揭示乙烯調(diào)控小白菜開花機制2024/2/22

不結(jié)球白菜（Pak-choi），俗稱小白菜，是一種原產(chǎn)于中國的多葉狀蔬菜，已逐漸在世界范圍內(nèi)種植。小白菜易于早熟的特性，限制了生長發(fā)育和產(chǎn)量積累。因此，了解小白菜的開花調(diào)控機制對育種和產(chǎn)業(yè)具有重要意義...

DNA pull down技術(shù)助力揭示AP2/ERF類轉(zhuǎn)錄因子提高芍藥耐高溫能力的分子機制2024/1/31

芍藥是一種傳統(tǒng)的中藥材，并且具有欣賞價值，其生長發(fā)育經(jīng)常受到高溫脅迫的影響。褪黑素是一種內(nèi)源性微分子吲哚胺化合物，在各種生物體中具有多種生理功能，大量研究表明調(diào)節(jié)與褪黑素生物合成相關(guān)的基因來提高植物對...

應(yīng)用HaloTag pull-down技術(shù)鑒定了與胡楊CPK21互作的重金屬脅迫相關(guān)蛋白2024/1/29

鎘(Cd)污染因其毒性在全球范圍內(nèi)造成了嚴(yán)重的生態(tài)問題，重金屬對植物造成的傷害除了離子毒害效應(yīng)，還會影響植物的水分狀況，造成植物生理干旱。當(dāng)前，干旱也已成為全球農(nóng)林業(yè)生產(chǎn)和發(fā)展的重大威脅。胡楊（Pop...

轉(zhuǎn)錄因子PpNAC1和DNA去甲基酶PpDML1協(xié)同調(diào)控桃果實成熟2024/1/22

2023年11月22日，浙江大學(xué)張波教授課題組研究成果，發(fā)表在PlantPhysiology期刊上（影響因子7.4），文章題目為TranscriptionfactorPpNAC1ａndDNAdemet...

DAP-seq技術(shù)助力揭示MdBPC2轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控生長素的合成從而調(diào)控蘋果性狀2024/1/15

植物生長素（IAA）在植物生長發(fā)育過程中起著重要的作用。其化學(xué)本質(zhì)是吲哚乙酸。主要作用是使植物細(xì)胞壁松弛，從而使細(xì)胞生長伸長，在許多植物中還能增加RNA和蛋白質(zhì)的合成。目前BARLEYBRECOMBI...

DAP-seq技術(shù)在R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子LmMYB15調(diào)控金銀花分子機制研究中的應(yīng)用2023/11/15

綠原酸(CGA)是灰氈毛忍冬(Loniceramacranthoides，別稱：金銀花)最重要的活性藥物成分，在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)μ烊籆GA的需求急劇增長。雖然CGA生物合成的關(guān)鍵基因已有報道，但其轉(zhuǎn)錄調(diào)控機...