質譜在組學中的應用無疑是當前熱門的，而且各種組學都廣泛深入的得到了開展。這其中有一些比較有特色的應用領域，近十分熱門，它們前景如何?技術瓶頸在哪里?市場推廣還有哪些問題，值得相關專業人士思考。

質譜成像技術(Imaging MS)誕生了近20年，早主要是在二次離子質譜(SIMS)領域。MALDI-TOF質譜誕生之后，基于MALDI-TOF質譜的成像技術得以發展，并在其前5年迅速達到質譜熱點之一,并在小分子和整體小動物疾病標志物研究方面取得多項重要標志性成果。該技術對數據分析要求比較高，限制了其應用發展，比如，如何針對質譜成像的海量數據進行統計分析，還缺乏自動化識別質譜圖像的專業性統計分析軟件，如何采用串聯質譜可靠鑒定生物分子也一直難以突破。把顯微鏡和MALDI-TOF質譜聯用，相當于增加了一個成像維度，在降低假陽性方面起到了良好的作用。總體上看，質譜成像的硬件技術發展緩慢，基礎應用研究強烈依賴于軟件技術，離臨床應用還有不小的距離。

微生物質譜技術無疑是近幾年除了組學質譜技術之外第二大熱點。據報道，目前國內市場上MALDI-TOF微生物質譜有國外3家(生物梅里埃、布魯克、島津)和國內9家(毅新博創、江蘇天瑞(廈門質譜)、融智生物、廣州禾信、東西分析、安圖生物、復星醫藥、珠海美華、珠海迪爾智譜)。體外診斷技術公司(IVD)加入微生物質譜檢測領域，是近幾年的一大特色，說明IVD市場急需新技術介入，而質譜則被看好。從技術層面看，國外微生物質譜遠遠走在了前列，國內質譜對許多核心技術還缺乏深度理解和可行性解決方案。目前，多家國內外微生物質譜都獲得了CFDA的醫療器械許可，毅新質譜作為家獲得CFDA批準的國產飛行時間質譜企業，近年來在微生物質譜底層技術、質量標準、數據庫和臨床應用方面做出了杰出的貢獻，創建了微生物質譜鑒定云中心，2017年獲得了北京市科學技術進步獎。總體上看，微生物質譜企業非常看好該領域，但是市場到底有多大、多久可獲得利潤，并不十分確定。

細胞質譜技術(CytoMS)是指直接對細胞進行分析的質譜技術，可追朔到15年以前，當時采用的是激光捕獲微切割(LCM)從目標細胞上采集生物分子，然后在線或離線結合質譜進行分析，主要是蛋白質組學中采用此策略。單細胞免疫質譜技術(Single Cell ImmunoMS)是當前質譜新應用之一，采用多種不同金屬標簽的抗體對不同細胞分別進行標記，采用流式細胞進行分選，再采用ICP-TOF-MS對金屬標簽中的金屬元素進行定量檢測，后通過統計軟件進行分析，獲得疾病相關的細胞表位和后選生物標志物[6]。目前該技術可以分析細胞表面和細胞內部的近50種生物標志物，一次收集細胞數可達百萬個(含亞細胞)，正成為細胞分析領域的革命性技術，許多成果都發表在Nature、Science、Cell、PNAS等科學雜志上。