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初級(jí)會(huì)員 | 第8年

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PCR反應(yīng)被抑制或效率較低調(diào)整過程

時(shí)間:2024/9/24閱讀:248
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PCR反應(yīng)被抑制或效率較低調(diào)整過程:

一旦確定反應(yīng)被抑制或效率較低,則可采取一些步驟將效率值重新調(diào)整到理想范圍內(nèi)。

1、對(duì)于抑制作用,可去除模板濃度最高的反應(yīng)孔并重新分析標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果效率重新回到110% 以下,則分析良好。

2、另一種解決方案是重新純化模板。切記應(yīng)延長(zhǎng)干燥時(shí)間,以去除乙醇沉淀過程中的乙醇,或采用另外的柱上洗滌液將離液鹽從硅膠純化物中去除。

3、通過分析優(yōu)化可解決效率低下的問題。此過程有時(shí)相對(duì)簡(jiǎn)單,但在某些情況下,隨著分析復(fù)雜度的提高,優(yōu)化過程可能十分耗時(shí)費(fèi)力。

4、擴(kuò)增單個(gè)產(chǎn)物時(shí),將鎂的濃度提升至6mM 可提高反應(yīng)效率,但當(dāng)出現(xiàn)競(jìng)爭(zhēng)作用時(shí),則應(yīng)降低鎂的濃度。

5、在某些情況下(主要是多重反應(yīng)中),必須采用引物和探針優(yōu)化基質(zhì)。此時(shí),需檢測(cè)正向引物與反向引物的比值或濃度,有時(shí)甚至還需檢測(cè)探針比值,以找出分析的理想濃度組合。最佳引物濃度介于100至600nM之間,而最佳探針濃度則在100nM至400nM 之間。


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