檢驗科是醫院重要的醫技科室之一，應設有生化、免疫、微生物、門診、臨床血液、體液、PCR等實驗室，承擔醫院臨床標本的常規檢測及臨床藥物驗證的中心實驗室檢測工作。主要開展甲、乙、丙、丁、戊型肝炎、艾滋病、麻疹、風疹、流行性乙型腦炎、流行性腦脊髓膜炎、菌痢、梅毒、瘧疾、傷寒和副傷寒、霍亂等傳染性疾病的實驗室病原學檢測。
傳染病醫院的檢驗科，在專業設置及劃分上同綜合醫院基本相同，所不同的是，除開展的檢驗項目有所不同外，工作人員所接觸的大部分都是含原微生物的、具有傳染性的病人標本。
工作人員每天都可能受到潛在致病微生物感染的威脅，如果病原微生物從實驗室泄露，還可能在實驗室及其周圍，甚至更廣的范圍內造成疾病傳播或流行，因此，加強傳染病醫院臨床實驗室的生物安全防護非常重要，它既是醫院感染控。
檢驗科實驗室將有效的空間劃分為清潔區(辦公室、休息室、學習室)、緩沖區(儲存區、供給區)和污染區(工作區、洗滌區、標本儲存區、高壓消毒區)。PCR實驗室按照衛生部《臨床擴增檢驗實驗室管理暫行辦法》的要求劃分為①試劑儲存和準備區;②標本制備區;③擴增產物分析區。這種工作區域的嚴格劃分，很大程度上避免了病原體的交叉污染，同時為保護工作人員的安全和實驗室周圍環境的安全提供了有力的保證。
臨床醫療機構的檢驗科室為生物安全二級實驗室，按照生物安全二級實驗室的設施要求應配備經國家FDA批準的、符合國家標準的和高壓滅菌容器，并按期檢查和驗證以確保符合要求。另外，實驗室應安裝洗眼器和緊急噴淋裝置。
個人防護設備是減少操作人員暴露于氣溶膠、噴濺物以及意外接種等危險的一個屏障。實驗室所用任何個人防護裝備應符合國家有關標準的要求。在實驗室危害評估的基礎上,按其防護要求選擇適當的個人防護裝備。
醫院還必須為檢驗科工作人員提供的日常個人防護裝備主要有工作服(白大衣)、、工作鞋、帽子、一次性外科用口罩、一次性塑膠手套等。當操作可能含有高致病性病原微生物的標本或接觸患有烈性呼吸系統傳染性疾病患者的標本時，工作人員要改戴N95口罩、防護眼鏡等加強保護，實驗室還配有呼吸器、急救箱等裝置以備緊急情況下使用。
實驗室操作規范主要包括：標本運送規范、血清分離操作規范、標本操作規范、感染性物質操作規范、生物安全設備操作規范、消毒和滅菌操作規范、血液、體液及分泌物的操作規范、實驗室廢棄物處理規范等等。
在傳染病醫院，由于患者大都患有傳染性疾病，其血液、體液或其他的樣本中均可能含有傳染性的病原微生物。因此在樣本采集、運送、操作及高壓消毒時，除了要做好個體防護外，必須嚴格執行相應的操作規范。比如，選擇采集標本的容器可以是玻璃的，但使用塑料制品。標本容器應當堅固，正確地用蓋子或塞子蓋好后應無泄漏，建議使用合格的真空采集血液;標本的運送由接受過培訓的專門人員負責，為了避免意外泄漏或溢出，應當使用盒子等可以耐高壓滅菌或耐受化學消毒劑的二級容器，并將其固定在架子上使裝有標本的容器保持直立;
實驗室如接收大量的標本時需安排專門的房間或空間，標本內層容器的打開及血清的分離等操作要在生物安全柜內進行，并準備好消毒劑;運送類、第二類病原微生物菌(毒)種或樣本，應按照衛生部《可感染人類的高致病性病原微生物菌(毒)種或樣本運輸管理規定》進行運輸;利器(包括針頭、小刀、金屬和玻璃)應直接棄置于一次性使用的利器盒內，所有棄置的實驗室廢棄樣本、培養物和被污染的廢物，需交由專門有資質的人員經過高壓滅菌處理后方可運走。
