wafergen大通量PCR 的詳細介紹
單個平臺上的基因表達發現與驗證
PERFORM > 單次運行有 5,000個real-time PCR檢測
單個平臺,多種功能wafergen大通量PCR
啟用生物標記的發現和基因印記的驗證
預驗證
提供優化過的以**為重點的或基于通道的基因組
可自定義的
可設置數十到數千個基因,都是從自定義的設計中選出的預驗證或自定義的基因
高通量,高效率
>5000個孔,每個SmartChip的運行相當于>13個384孔組工作
節省成本
每孔反應體積為100nl,相比較微升級的real-time PCR可節省大量的資源
節省樣本
每次檢驗僅需要每孔100pg的總RNA
SMARTCHIP系統是**個基因表達平臺,集合了芯片的高通量特性和靈敏性,精密性及real-time的動態范圍。現在,在一次實驗中一次運行>5000個檢測,驗證數千個基因已成為可能。多條通道的表達譜,**相關的基因,或非編碼RNAs可以在一天之內,用證實的real-time PCR技術,以一個新的高密度格式在一個運行里進行分析。
SmartChip系統可在且不限于以下應用中使用:
驗證**特性和引導靶向****
完成從發現到臨床**的生物標記的發展
為病人分層或潛在**研究工具做分子診斷的研究指南
SmartChip系統提供了一個高度靈活的平臺,平臺上有預設計并確認了的SmartChip面板,每個組上的芯片包括一式四份的1000個基因。使用者也可以自行設計和自定義SmartChip面板,每個面板上可有從數十到數千不等的基因,并可以在每個芯片上檢測數十到數百個不同的樣品。另外,WaferGen Biosystems 通過SmartChip Services提供SmartChip技術的有權使用。SmartChip Services能執行一個簡單的評估或完整的復雜生物標記驗證項目。
自由擴展你的實驗設計
進行頻譜*的基因表達檢測
每次SmartChip運行可做>5000個反應,研究者可*自由的使用real-time PCR,而在別的平臺上不能用該種方式。
假設無表達譜:
使用定量real-time PCR的金標準方法來驗證從第二代測序或芯片表達譜中發現的有聯系的基因。SmartChip系統用real-time PCR以一種低價的方式來驗證大量翔實的生物標記。
以假設為基礎的表達譜:
在以假設為基礎的研究中,在通道上和著力于**的程度上發現一個翔實的生物標記。現有的技術能將每個實驗的通量限制為96或384個基因。SmartChip系統可以再每個運行中完成一式四份的1000個基因,有效地在一次檢測中分析更多的基因。
特性驗證:
用SmartChip自定義面板上的大量樣品,使用相同的技術以驗證數十到數百個基因的信息。
在一個5184孔板的real-time PCR系統里的通量能力的短時間內,完成使用者的驗證研究
高通量PCR反應采用標準技術
不用更多的工作量就可以完成更多的實驗
SMARTCHIP系統通過納升級real-time PCR的關鍵革新,使一個完整的高密度、高通量real-time PCR方案成為可能。該系統的核心是SmartChip納米孔芯片,是基因組分析的完整解決方案,芯片上具有72x72孔,每個孔的有效體積是100nL。該構造可以在2小時左右完成5,184個納米級的定量real-time PCR反應,而且其得到的數據質量是與傳統定量real-time PCR一致的。SmartChip納米孔芯片可以以兩種方式提供給使用者:根據驗證過的實驗制作的SmartChip面板或根據使用者定義實驗制作的SmartChip自定義面板。上樣和運行SmartChip面板的上下游工作流程使用建立好的實驗室技術和現成的貨架,優價的試劑。
甚*樣cDNA/ Real-Time Master-Mix 到SmartChip面板是個簡單的10-20分鐘的過程,能產生高精度的數據。與此相反, 微流體芯片或復雜的試劑上樣流程會消極地影響數據、質量和操作時間。
驗證生物學特性都需要動態范圍和靈敏度,這兩者通常分別被雜交芯片或第二代測序所限。
Real-time PCR 沒有此限制。現有的real-time PCR技術一次只能分析96到384個基因。SmartChip 系統能驗證大量推測的標記,所以更多的翔實的基因可以在一次運行中分析得出。另外,可以自定義在數十到數百的基因組較小范圍內,允許顧客通過在每個芯片上多個樣品的驗證標記,在整個驗證過程中來使用SmartChip技術。
突破性技術使實驗更加具備靈活性
自定義平臺的優勢性
SmartChip納米級加樣器
單步的加樣:在整個5184孔SmartChip面板中加入cDNA和Real-Time PCR Master混合的溶液,整個過程僅為簡單一步完成,時間短于10分鐘。
SmartChip多樣品納米級加樣器
具靈活性的樣品:可以在一個SmartChip面板上自動加樣多于384個樣品
經過驗證的性能:在納升量上顯示其精度
可靠的結果: Active evaporation control and chip cooling station.
迅速的加樣:在短短10分鐘內即可準備好一整塊72x72 SmartChip面板
SmartChip循環器
快速的結果:熱循環,在大約2小時內可以在5184納米孔的SmartChip上收集
便捷的操作:可用于數據收集和分析的強大且直接的工具,包括SmartChip qPCR軟件
**的溫度:有效地溫度控制,在芯片各孔間的Ct標準偏差< 0.1
SmartChip qPCR軟件
自動化的SmartChip qPCR軟件分析: 自動地需找加樣孔,Ct值的確定和輸出數據
直接的接口:單一的數據接口和分析工具
發現和驗證的嚴格試驗測試
復合型面板獲得質量結果
檢測的驗證
每個real-time SYBR® Green PCR檢測包括在一個SmartChip面板里,經過大量的質量控制步驟以在納升規模上確保檢測功能的可復制性
低可變性
SmartChip系統設計用以產生**的數據。樣品加樣,溫度一致性和熒光一致性都可被控制,在5184個SmartChip納米孔的芯片上具有高精度性。
SmartChip人類腫瘤學面板
理想的腫瘤**相關基因的表達譜
968個基因特異的檢測,覆蓋16個功能面板,一式四份
包括11個內源性和6個外源性對照
SmartChip人類microRNA面板
理想的**分析microRNA 目的基因
針對人類miRBase 版本14.0設計的778個microRNA特別的檢測,一式四份
包括12個內源性和6個外源性對照
實驗多功能的自定義服務
發現real-time生產力
SmartChip自定義面板
SmartChip自定義面板使使用者可以在一個驗證了的工作流程中,在一個較小基因組上配置許多樣品。可以發展使用者自己的特殊應用的real-time PCR檢測面板,或從廠家的檢測文庫里選擇得到,或由廠家為使用者開發一個面板。WaferGen Biosystems 可以設計、優化和提交SmartChip自定義的面板,其芯片上具有數十到數百的重復排列的檢測組,可以在使用者的real-time PCR驗證研究中為其節省時間和成本。
SmartChip Services
現在開始使用SmartChip Services對您的高通量基因表達進行研究。
WaferGen Biosystems在使用者得驗證研究中,用*新的預驗證的SmartChip面板或自定義的面板,在一個專門的設施中執行SmartChip Services。根據提交樣品的數目不同,大多數項目可在1或2周內完成
服務包括:
輔助研究設計
對樣品的上樣質量控制
產生數據
項目分析
高密度,高通量,real-time PCR—已成現實!
用不復雜的工作流程獲得物美價廉和高質量的結果
在單一平臺上將芯片的高通量特性和實時定量PCR的高靈敏度、高精度和線性范圍的*組合
理想化的基因表達發現和第二代測序或芯片實驗得到數據的目標驗證
納米級的高密度反應能確保降低成本和快速得到結果的實現
Unique combination of the high-through