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經廣東省機構編制委員會批準，在廣東省微生物研究所的基礎上成立“廣東省微生物分析檢測中心”，并于1999年通過計量認證（CMA），具有獨立法人地位和第三方實驗室地位。2004年共43類172項檢測項目通過中國實驗室國家認可委員會（CNAL）認可，檢測數據可獲得國際互認，成為可為社會提供用于貿易出證、產品質量評價、成果鑒定的公證數據的合法檢測機構，具有法律效力。檢測中心按照ISO/IEC17025：2005建立了完善的管理體系，技術力量雄厚，檢測設備齊全，保證檢測工作高質量，做到科學性、公正性和準確性，服務周到、熱情、優質。檢測中心自成立以來，已贏得了全國各地廣大客戶的信賴，在華南地區乃至全國享有一定的知名度和影響力，省內外一些食品、醫藥、日用品、化工、生物、環保和農業等領域的大型企業長期委托本中心進行分析檢測以及幫助他們解決生產過程中的質量監控問題。檢測中心現為中國抗菌材料及制品行業協會“抗菌標志產品”抗菌性能指定推薦檢驗機構、中日兩國“抗菌互認”指定推薦檢驗機構及廣東省輕工協會—香精香料化妝品洗滌用品專業分會推薦的微生物檢驗機構。